最近在用precisionFDA的benchmarking-tools比对NIST的一个样本的标准vcf看我们的pipeline好坏。吐槽了github下载速度和clone速度都是相当的。。。终于下下来看需要8version的java,于是sudo yum install java,安装后java -version发现并没有覆盖原来版本。于是想当然找到了/usr/bin/下的java,修改了默认指向symbolic link,发现没用,于是有下文。
TCGA数据相当有利用价值,然而其提供开放下载数据很少,都是大于level1的数据,除非其数据已发表相关文章,否则很难下载到。前一段时间,为了下载TCGA的原始数据花了不少时间,虽然可以下载,但下载速度很慢,至今找不到解决方法。但下载过程,使用可以记录一下,方便后续解决问题寻根究源。
经常听到一些计算机术语,一知半解很久,作为一个天天搞计算的人来说很惭愧,今天决心看一下处理器中的几个概念。